先天性心脏病患者可以移植心脏，一般心脏移植术针对的是通过外科、介入等各种方法都不能治好，且预期寿命不超过半年或一年的终末期先心病患者。而大部分先天性心脏病患者通过开刀手术治疗后都能达到一个非常满意的效果。
对于复杂类型的先心病，在外科常规治疗无效的情况下，进行心脏移植的效果也相当不错。目前我们国家先天性心脏病做心脏移植术的往往是小儿，婴幼儿或者是儿童，因为先心病做心脏移植术后排异反应轻、用药小，效果就要比成年人要好。但是心脏移植术后的儿童有个最大的不确定性，就是小儿和家长对于后续药物治疗的依从性较差。部分人觉得术后一切都好，不用吃药，就擅自停药，这样就会造成排异反应，甚至是死亡。成功的经验非常多，但是失败的教训一旦发生也十分惨痛。如果按照医生严格要求复查，手术效果应该比成人效果要好。