法洛氏四联症是遗传和环境因素等复杂关系相互作用的结果，下列因素可能影响到胎儿的发育而产生先天性的畸形：
1、胎儿发育的环境因素：感染，妊娠前三个月患病毒或细菌感染，尤其是风疹病毒和柯萨奇病毒，其出生的婴儿先天性心脏病的发病率较高。其它如胎儿受压、妊娠早期先兆流产，母体营养不良、糖尿病、高血钙，放射线和细胞毒性药物在妊娠早期的应用，母亲年龄过大均有使胎儿发生先天性心脏病的可能；
2、遗传因素：先天性心脏病具有一定程度的家族发病趋势，可能因父母生殖细胞、染色体畸变所引起的。遗传学研究认为，多数的先天性心脏病由多个基因与环境因素相互作用而形成；
3、其它因素：有些先天性心脏病在高原地区较多，有些先天性心脏病有显著的男女性的性别差异，说明出生地海拔高度和性别也与本病有相关性。