新生儿败血症是新生儿期严重的感染性疾病，其发生可合并有神经系统的并发症，比如化脑会有严重的后遗症产生，如癫痫，运动、语言发育落后，或者视听功能受到影响。短期败血症可以引起多脏器损害，比如可以有合并有肺部感染、骨髓炎，短期后遗症主要是多脏器损害表现，比如引起肺部感染，出现呼吸的困难、缺氧表现。远期后遗症，主要是神经系统的后遗症，最严重的有硬脑膜下积液、癫痫、视力障碍、听觉障碍，还有运动功能障碍。
新生儿败血症的远期后遗症主要是神经系统后遗症，比如合并有化脑，可能会引起脑积水、室管膜炎、硬膜下积液。如果治疗不规范，或耐药菌治疗效果不好，可能会产生视力障碍、听觉障碍，以及语言、运动、智力发育落后，会造成不同程度的损害。所以孩子出现感染，一定要早诊断，及早治疗，争取把后遗症降低到最低。