新生儿呼吸窘迫综合征的预防是非常重要的，现不提倡预防性的使用肺泡表面活性物质，但如果是极早的早产儿，出生后半小时之内或在产房之内，就给予婴儿肺泡表面活性物质，来预防新生儿呼吸窘迫综合征的发生或者减轻其程度，多用于产前未使用产前激素预防的新生儿。越早使用，效果越好，最好在婴儿的呼吸开始前或是在呼吸机正压呼吸开始之前，从气管插管内滴入肺泡表面活性物质，可以使复合磷脂在肺内均匀分布。预防的效果表现在新生儿呼吸窘迫综合征的发生率和病死率明显下降，发病者的情况较没有预防的患儿是减轻的。此外，新生儿呼吸窘迫综合征的其他预防措施如下：
1、产前使用糖皮质激素，促进胎儿的肺发育成熟；
2、经常清除新生儿咽部的黏液，保持气道的通畅。