常见的衣原体感染包括沙眼衣原体、肺炎衣原体、鹦鹉热衣原体。临床最常见是沙眼衣原体和肺炎衣原体。衣原体感染起病比较隐匿，发病年龄在半岁以内，尤其是3个月左右。早期是一般的感冒症状，比如鼻塞、流鼻涕、轻微咳嗽。随着病情进展，咳嗽会加重，尤其到合并肺炎时，会出现痉挛性咳嗽，叫类百日咳样咳嗽，表现为阵发、持续成串的咳嗽。
在临床工作中，小年龄组，尤其是3个月左右，6个月以内的孩子，如果出现痉挛性咳嗽，首先怀疑衣原体感染，但是要结合母亲孕期病史、孩子有无发热等，还要结合肺部听诊、辅助胸片等检查，进一步明确诊断。