小儿抽动症的发病原因较多，属于儿童行为的异常性疾病。目前病因不清，很多研究认为是多因素疾病，与先天因素、后天因素、环境因素、遗传因素、感染因素、生活环境都有很大关系。除少数患者会迁延不愈外，多数患儿预后良好。部分患儿随年龄增长，病情会逐步减轻或症状局限化，说明该疾病存在一定自愈性，但自愈率比例偏低，特别是慢性抽动障碍和抽动秽语综合征患儿，病程在1年以上者自愈率更低。
抽动症患儿在成年期存在三种结局，近半数患者病情得到缓解，有30%-50%的患儿症状减轻，有5%-10%的患儿病情迁延不愈，到成年期还会存在，症状一般不会进一步加重。所以患有抽动症儿童应该积极治疗，对预后有很大影响。